【比較表】くん蒸・消毒・植物検疫サービスの主要事業者11者を事実項目で整理

比較の前提：担い手の層が違うため、同じ物差しでは測れない

最終更新日: 2026年10月16日

本ページは植物防疫所が公開する指定くん蒸倉庫一覧と各社の公式サイトで確認できた事実だけを並べています。サービスの優劣や規模の評価は行わず、順位も付けません。確認できない項目は「公式サイト参照」と表記しています。

くん蒸や消毒の担い手は、一つの業種に収まりません。港湾運送や倉庫の事業者が施設を運営する例、くん蒸の作業そのものを専門に請け負う作業会社、虫やネズミの管理を本業にする防除事業者、そして制度の側で認定や登録を行う機関が、それぞれ異なる役割を持っています。本ページの比較表は、こうした層の違いを「事業形態」の列で示し、同じ表の中に並べています。層が異なる事業者を同じ表に載せるのは、荷主や担当者が最初に直面する疑問が「誰に何を頼めるのか」という整理だからです。

表に載せた事業者は、植物防疫所が公開する指定くん蒸倉庫の一覧に名前が出ているもの、公式サイトにくん蒸の事業を掲載しているもの、輸出用木材こん包材の制度で登録されている機関のいずれかに該当し、存在と事業内容を公式の情報で確認できた事業者に限っています。ここに載っていない事業者が劣っている、あるいは載っている事業者が選ばれるべきという意味は一切ありません。掲載は網羅を意図しておらず、他にも指定を受けている事業者や、くん蒸の作業を請け負う事業者は多数あります。

表の数値のうち、指定くん蒸倉庫の掲載数は、植物防疫所の指定一覧（PDF）で、事業者名の表記に当該社名を含む施設番号を集計したものです。倉庫とサイロは施設種別の区分で分けています。一つの施設が複数の区画に分かれて指定されることがあり、数値は事業の規模や処理能力を示すものではありません。また、指定は3年ごとの更新で、一覧は随時更新されます。公式サイトで確認できなかった項目は、推測で補わず「公式サイト参照」としています。

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【比較表】くん蒸・消毒・植物検疫サービスの主要事業者

事業者	事業形態	本社・所在地	公式サイト等で確認できる事業・処理	指定くん蒸倉庫の掲載数（倉庫／サイロ）	掲載のある防疫所管内	登録・認定	公表実績
株式会社上組	港湾物流・倉庫系	神戸市中央区浜辺通四丁目1番11号（本店）	港湾運送、倉庫・保管、フォワーディング、3PL、輸送。くん蒸の記載は公式トップページには見当たらない	188／716	東京、横浜、名古屋、神戸、大阪、広島、福岡、門司、鹿児島、札幌、塩釜、新潟	指定くん蒸倉庫（植物防疫所）	指定一覧に掲載あり
三井倉庫株式会社	港湾物流・倉庫系	公式サイト参照	倉庫（国内外）、港湾運送、航空貨物フォワーディング、3PL、陸上貨物運送。くん蒸の記載は公式トップページには見当たらない	39／64	東京、横浜、名古屋、神戸、福岡	指定くん蒸倉庫（植物防疫所）	指定一覧に掲載あり
株式会社住友倉庫	港湾物流・倉庫系	公式サイト参照	国内物流、国際物流、港湾運送、アーカイブズ・トランクルームなど。くん蒸の記載は公式トップページには見当たらない	7／0	神戸	指定くん蒸倉庫（植物防疫所）	指定一覧に掲載あり
東洋埠頭株式会社	港湾物流・倉庫系	東京都中央区晴海	倉庫業、港湾運送業、自動車運送業、国際物流。川崎支店は拠点一覧に掲載。くん蒸の記載は公式トップページには見当たらない	60／121	東京、横浜、大阪、福岡、坂出、鹿児島	指定くん蒸倉庫（植物防疫所）	指定一覧に掲載あり
日本通運株式会社（NXグループ）	総合物流系	公式サイト参照	航空・海上・陸上の輸送、倉庫・流通加工、通関、物流コンサルティングなど。くん蒸の記載は英語版トップページには見当たらない	57／24	東京、名古屋、札幌、福岡、門司、坂出、鹿児島	指定くん蒸倉庫（植物防疫所）	指定一覧に掲載あり
鈴与株式会社	港湾物流・倉庫系	静岡市清水区入船町11-1	DC・倉庫、国内輸送、国際輸送・輸出入、港湾運送など8事業。くん蒸の記載は公式トップページには見当たらない	11／33	清水	指定くん蒸倉庫（植物防疫所）	指定一覧に掲載あり
株式会社ユニエツクスNCT	倉庫系（くん蒸設備併設）	横浜・大黒ふ頭内	倉庫内にくん蒸設備を持つ。薬剤は臭化メチルとリン化アルミニウム。160坪・80坪・40坪のくん蒸庫。青果物の2時間くん蒸に対応と記載	2／0（一覧上の表記はユニエックスNCT）	横浜	くん蒸庫の特A級指定（公式サイトの記載）	あり（公式サイト）
東海埠頭株式会社	港湾の作業会社（くん蒸専業部門）	静岡市清水区横砂408番地の13	植物検疫くん蒸事業としてサイロ、倉庫、木材天幕を扱い、コンテナ専用くん蒸庫もある。薬剤は臭化メチル、シアン化水素、リン化アルミニウムなどと記載	同名での掲載は確認できず（0）	清水港（公式サイトの記載）	公式サイトに指定・認定の記載なし	あり（公式サイト）
イカリ消毒株式会社	防除系	東京都渋谷区千駄ヶ谷5-27-11	防虫防鼠を含む総合的有害生物管理（IPM）、衛生管理のコンサルティング・監査、検査・分析。くん蒸・検疫の記載は公式トップページには見当たらない	掲載なし	該当なし	公式サイト参照	防除の公表事例は公式サイト参照
一般社団法人全国植物検疫協会	登録機関（消毒証明実施機関）	東京都千代田区	輸出用木材こん包材の消毒実施者の認定と、木材こん包材生産者の登録	対象外	全国（制度上の登録）	消毒証明実施機関（登録2025年5月10日、初登録2007年5月10日）	認定者・登録者の一覧は同機関のサイト参照
一般社団法人全国木材検査・研究協会	登録機関（消毒証明実施機関）	東京都千代田区	輸出用木材こん包材の消毒実施者の認定と、木材こん包材生産者の登録	対象外	全国（制度上の登録）	消毒証明実施機関（登録2025年5月10日、初登録2007年5月10日）	認定者・登録者の一覧は同機関のサイト参照

2026年10月時点、各社公式サイト・公開資料に基づく。最新情報は各社サイトで確認してください。

比較表の読み方：掲載数が示すもの、示さないもの

最初に目を引くのは、指定くん蒸倉庫の掲載数の差です。港湾物流の大手は複数の防疫所の管内にまたがって掲載があり、数百の施設番号になる例があります。一方で、くん蒸設備を持つ特定の倉庫や、くん蒸の作業を専業にする会社は、自社名義の指定が少ない、あるいは一覧に同名の掲載がない場合もあります。これは、指定を受ける主体が、施設を所有・運営する事業者であるのに対し、作業会社は他者の指定施設で作業を請け負う場合があるためです。掲載数の違いは、役割の違いの反映であり、優劣の指標ではありません。

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次に、「掲載のある防疫所管内」の列は、事業者が活動している港の広がりを知る手がかりになります。ただし、一覧に載る港は、指定の対象になる港頭地域または飛行場内に限られます。植物防疫法施行規則は、指定の対象になる港を定めており、すべての港で指定くん蒸倉庫が設けられるわけではありません。対応する港の確認は、最寄りの植物防疫所の一覧で行うのが確実です。

「登録・認定」の列は、制度上の位置づけを示します。指定くん蒸倉庫は輸入検疫の消毒に使う施設で、等級（特A、Aなど）は気密性などで決まります。ユニエツクスNCTの公式サイトは、くん蒸庫として特A級の指定を受けていると説明しています。消毒証明実施機関は、輸出用木材こん包材の制度における認定・登録の主体で、事業者そのものがくん蒸を行うわけではありません。この区別を押さえておくと、同じ「くん蒸・消毒」という言葉でも、表の各行が別の層の話であることが分かります。

最後に、公表実績の列は、公式サイトなどで事業の記載があるかどうかを示しています。具体的な取扱量や処理実績は、多くの事業者が公表していません。取扱量を知りたい場合は、各社に直接確認する必要があります。本サイトは、公表されていない数値を推定で補うことはしません。

依頼先を検討するときに確認する事実項目

くん蒸や消毒を依頼する立場では、事業者を選ぶ前に、まず自分の貨物がどの制度の下にあるのかを整理する必要があります。輸入貨物で検疫有害動植物が見つかり、消毒を命じられた場合は、指定くん蒸倉庫など植物防疫所が認めた施設で処理を行います。輸出用の木材こん包材であれば、消毒証明実施機関に認定された実施者か、登録された生産者のもとで処理と表示を行います。防虫や防鼠の管理は、これらとは別の民間契約で、制度上の認定は前提になりません。

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事業者に問い合わせる際に確認できる事実項目として、次のような点が挙げられます。対象とする貨物の種類（青果物、穀物、木材、コンテナ貨物など）、対応する処理（くん蒸、熱処理、選別など）、対象の港や地域、植物防疫所の指定や登録の有無と有効期間、作業主任者など資格者の配置、事故時の連絡体制、書類の発行範囲です。これらは事業者の優劣ではなく、自社の貨物と制度に合うかどうかを確かめるための項目です。

くん蒸の作業には、毒性のある薬剤が使われます。作業の安全管理は、植物検疫くん蒸における危害防止対策要綱で、統括責任者や作業主任者の配置、立入禁止の表示、ガス濃度の測定などが定められています。依頼側も、作業日程の調整や関係者への周知の場面で、この仕組みを理解しておくと、事業者とのやり取りが円滑になります。詳しくは資格・安全・キャリアのページで扱っています。

各プレイヤーのプロフィール：確認できる事実

株式会社上組：港湾物流の事業者として複数の防疫所管内に指定施設

上組は、神戸市中央区浜辺通四丁目1番11号に本店を置く港湾物流の事業者です。2024年9月30日時点の会社概況資料では、創業は1867年、株式会社としての設立は1947年2月28日と記されています。東京本社は港区芝浦にあります。事業内容は港湾運送、倉庫、国内運送、工場荷役請負、国際運送などで、公式サイトでは総合物流サービスとして港湾運送、倉庫・保管、フォワーディング、3PL、輸送が挙げられています。植物防疫所の指定くん蒸倉庫の一覧では、東京、横浜、名古屋、神戸、大阪、広島、福岡、門司、鹿児島、札幌、塩釜、新潟の各拠点に掲載があり、名義に社名を含む掲載は倉庫が188、サイロが716です。くん蒸そのものの事業は、公式トップページには記載が見当たりません。

三井倉庫：倉庫・港湾運送を軸にした総合物流の事業者

三井倉庫は、公式サイトで三井倉庫グループとして、倉庫（国内・海外）、港湾運送、航空貨物フォワーディング、3PL・LLP、陸上貨物運送などの物流事業を紹介しています。植物防疫所の指定くん蒸倉庫の一覧では、東京、横浜、名古屋、神戸、福岡の各拠点に名義の掲載があり、倉庫が39、サイロが64でした。神戸植物防疫所管内の関西支社関西第一支店名義の掲載がもっとも多く、倉庫の施設番号が18あります。本社所在地は公式トップページに記載がないため、表では公式サイト参照としています。くん蒸サービスの有無は、公式トップページからは確認できません。

住友倉庫：神戸支店名義で指定くん蒸倉庫を掲載

住友倉庫は、公式サイトに国内物流、アーカイブズ・トランクルーム、国際物流、港湾運送、情報システム、不動産開発・賃貸、ソリューションの各事業を掲げる総合物流の事業者です。植物防疫所の指定くん蒸倉庫の一覧では、神戸植物防疫所管内に神戸支店名義の倉庫が7件掲載されています。サイロの掲載はありません。本社所在地は公式トップページに記載がなく、会社概要ページで確認できます。くん蒸の事業そのものについて、公式トップページには記載が見当たりません。

東洋埠頭：倉庫業・港湾運送業を持つ埠頭会社

東洋埠頭は、公式サイトで倉庫業、港湾運送業、自動車運送業とその他の業務、国際物流事業の四つを事業として挙げています。有価証券報告書などの公開資料によると、本社は東京都中央区晴海にあり、前身は1929年に設立された日満倉庫株式会社で、1947年に現在の社名となり、1949年に川崎支店が開設されました。植物防疫所の指定くん蒸倉庫の一覧では、横浜植物防疫所管内の川崎支店名義の掲載が大きな割合を占めています。全体の掲載数は倉庫が60、サイロが121で、東京、横浜、大阪、福岡、坂出、鹿児島の各拠点に名義の掲載があります。

日本通運（NXグループ）：総合物流の事業者として複数拠点に掲載

NXグループ（旧・日本通運グループ）は、公式の英語サイトで、航空・海上・陸上の輸送、プロジェクト物流、倉庫・流通・フルフィルメント、通関、物流コンサルティングなどを提供する企業グループと説明されています。創業は1937年で、2025年12月時点で56の国と地域に2,900以上の拠点、従業員は77,925人と記載されています。植物防疫所の指定くん蒸倉庫の一覧には、日本通運株式会社の各支店名義で、東京、名古屋、札幌、福岡、門司、坂出、鹿児島の各拠点に掲載があり、倉庫が57、サイロが24でした。くん蒸や植物検疫に関する記載は、英語版トップページには見当たりません。

鈴与：清水港を拠点とする総合物流の事業者

鈴与は、静岡県静岡市清水区入船町11-1に本社を置く総合物流の事業者で、1801年に廻船問屋として創業したと紹介されています。公式サイトでは、DC・倉庫事業、国内輸送事業、国際輸送・輸出入事業、海外事業、港湾運送事業、物流情報サービス事業、データソリューション事業、リース事業の八つの事業が示されています。植物防疫所の指定くん蒸倉庫の一覧では、清水支所の管内に掲載があり、倉庫が11、サイロが33です。くん蒸や植物検疫そのものの事業内容は、公式トップページには記載がなく、各事業ページで確認する必要があります。

ユニエツクスNCT：大黒ふ頭の倉庫内にくん蒸設備

株式会社ユニエツクスNCT（英語表記UNI-X NCT Corporation）は、公式サイトで、横浜の大黒ふ頭内にある倉庫内のくん蒸設備を紹介しています。使用する薬剤は臭化メチルとリン化アルミニウムの二種類で、くん蒸庫は160坪、80坪、40坪の三種類があり、貨物量に応じて使い分けるとされています。攪拌能力と排気能力に優れた設備により、青果物の2時間くん蒸に対応すると記載され、植物防疫所の審査基準をクリアしたくん蒸庫として特A級の指定を受けているとしています。植物防疫所の指定一覧では、横浜植物防疫所管内に倉庫2件の掲載があります。

東海埠頭：清水港の植物検疫くん蒸の作業会社

東海埠頭株式会社は、静岡県静岡市清水区横砂408番地の13に所在し、公式サイトで植物検疫くん蒸事業を紹介しています。清水港唯一の作業会社と記載されており、サイロくん蒸、倉庫くん蒸、木材天幕くん蒸を扱います。倉庫くん蒸では青果物、植栽用植物、穀類、木材などを対象にし、コンテナをシャーシーに積んだまま処理できるコンテナ専用くん蒸庫があるとされています。使用薬剤として、臭化メチル、シアン化水素、リン化アルミニウムなどが挙げられています。植物防疫所の指定一覧に同名義の掲載は確認できませんでした。

イカリ消毒：防虫防鼠を中心とした防除事業者

イカリ消毒株式会社は、東京都渋谷区千駄ヶ谷に本社を置く防除事業者で、公式サイトで防虫防鼠をはじめとする総合的有害生物管理（IPM）を、工場、倉庫、ビルなど向けにワンストップで提供すると説明しています。このほか、衛生管理のコンサルティング・監査や、混入異物、微生物、食品、水質などの検査・分析も事業としています。商品カテゴリには防虫、防鼠、洗浄・消毒、DX、その他、書籍の六つがあり、DXとIoTの表記もあります。植物検疫のくん蒸を行う事業者としての記載は、公式トップページには見当たりません。防虫管理の技術は倉庫害虫モニタリングの比較表で扱っています。

全国植物検疫協会と全国木材検査・研究協会：消毒証明実施機関

農林水産省の植物防疫所のページによると、輸出用木材こん包材の消毒について、農林水産省消費・安全局長に登録された消毒証明実施機関は二つあります。一般社団法人全国植物検疫協会と、一般社団法人全国木材検査・研究協会で、どちらも東京都千代田区にあります。登録年月日は2025年5月10日で、初登録は2007年5月10日です。両機関は、消毒実施者の認定と、木材こん包材生産者の登録を担っています。認定消毒実施者と登録生産者の一覧は、各機関のホームページで確認できます。両機関は、くん蒸や熱処理そのものを行う事業者ではなく、制度の運営を担う機関という位置づけです。

一次情報の確認先と次のページ

次のページでは、くん蒸の背景にある薬剤の規制と、臭化メチル代替と処理技術の動きを整理します。